Фамилия Лишинская — женская форма фамилии Лишинский, которая образована от мужского имени или прозвища Лиша. Основатель рода, скорее всего, был человеком из простого сословия.

Откуда взялось имя Лиша, не до конца ясно. Есть две основные версии. Первая: Лиша — это сокращённая, обиходная форма полных имён, таких как Липат (от греческого «высочайший»), Листрат («добрый воин») или Ливаний («обитатель Ливана»). Вторая версия ведёт происхождение от прозвища, связанного с глаголом «лишати» — «лишать». В этом случае Лишей могли называть бедного человека или того, кто потерял дом и имущество, например, из-за пожара. Обе версии равноправны, но вторая точнее отражает бытовую логику прозвищ: называть человека по его беде было в народе обычным делом.

Фамилия оформилась с помощью суффикса -ин- (Лишин) и топонимического суффикса -ск-, который указывает на принадлежность к роду или местности. Модель Лишин-ский типична для польской, украинской и западнорусской традиции, где фамилии на -ский/-цкий первоначально носили дворяне, но позже распространились среди всех сословий.

В исторических документах фамилия встречается. В Книге памяти Кемеровской области упомянут Лишинский Виктор Иванович, родившийся в 1891 году в Новосибирской области. Это говорит о том, что к концу XIX века носители фамилии жили в Сибири, куда могли переселиться из западных губерний Российской империи.