Фамилия Лиско — редкий случай, когда суффикс сам по себе задаёт загадку. В русских фамилиях часто встречаются окончания -ов, -ев, -ин, а здесь — -о. Такая модель указывает на украинское или белорусское происхождение: фамилии на -о (Лиско, Стецько, Шинкаренко) характерны для западнорусских земель и юго-западной части России, куда переселялись выходцы из Малороссии.

Основа фамилии — прозвище Лис, Лисько или Лиско. В славянской традиции лис — животное хитрое, изворотливое, но не всегда отрицательное. Прозвище могли дать человеку с рыжими волосами, льстивому в разговоре или, наоборот, тому, кто умел выпутываться из сложных ситуаций. В украинских говорах «лиско» иногда означало и просто «лисёнок», то есть уменьшительно-ласкательное прозвище младшего или невысокого ростом.

Есть и другая версия, менее распространённая, но имеющая право на существование: Лиско — вариант фамилии, образованной от имени Лисовский через усечение. Однако это маловероятно: фамилии на -ский обычно принадлежали дворянству, а Лиско — типичная крестьянская или казачья фамилия. В реестрах запорожских казаков XVII века встречаются прозвища Лис, Лисенко, что подтверждает народный, а не искусственный характер фамилии.

Географически фамилия Лиско чаще всего встречается на западе Украины (Львовская, Тернопольская области) и в приграничных районах Беларуси. В России её носители сосредоточены в Краснодарском крае и Ростовской области — регионах, куда в XIX–XX веках переселялись украинские крестьяне.

Словообразовательно фамилия проста: корень лис- и суффикс -к- со значением уменьшительности или принадлежности. Окончание -о — типичный украинский маркер, который в русском языке воспринимается как неизменяемое. В отличие от фамилий вроде Лисицын, где суффикс -ин указывает на прямую принадлежность («чей?»), Лиско — это прозвище, застывшее в форме обращения: «чей ты?» — «Лисков», но со временем окончание стало восприниматься как часть основы.