Фамилия Лопаткина образована от русского мирского имени Лопата. Такие «инструментальные» имена, как Топор, Молот или Лопата, в старину давали без церковного крещения. Имя Лопата могло указывать на внешность или характер: так называли человека неповоротливого, широкого в кости, возможно, с крупными ступнями или ладонями. Однако не стоит исключать и профессиональную подоплёку: лопатой пользовались землекопы, гробокопатели, хлебопёки (сажать хлеб в печь) и даже воины (сапёрная лопата). Выяснить точное значение имени Лопата у конкретного предка без родословной невозможно — обе версии равноправны.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Лопаткина буквально означает «дочь (или жена) Лопатки». Сама форма Лопатка — это уменьшительное от Лопата, то есть ласковое или обиходное прозвище. Фамилия с таким суффиксом характерна для северных и центральных областей России, где -ин так же распространён, как -ов на юге.

В отличие от фамилии Лопатин, которая образована напрямую от слова «лопата» без уменьшительного суффикса, Лопаткина звучит более «домашне», указывая на конкретного человека по прозвищу Лопатка. Встречаются и однокоренные фамилии Лопатников (от названия профессии — лопатник, мастер по изготовлению лопат) и Лопатьев (от старой формы «лопать»). Таким образом, Лопаткина стоит в ряду прозвищных фамилий, где за бытовым предметом стоит живая человеческая характеристика.