Фамилия Лубнина — одна из тех, что прямо указывает на занятие предка. В её основе лежит слово «луб» — так называли липовую исподнюю кору, которую использовали в хозяйстве повсеместно: крыли ею кровли (под тёс), драли мочало, заготавливали лыко для плетения. Человек, который этим промышлял, получал прозвище Лубник. Он мог заготавливать луб в лесу или делать из него корзины-лубянки — простую и ходовую утварь.

Словообразовательная модель здесь простая и прозрачная. К основе «луб» добавили суффикс -ник-, типичный для названий ремесленников (ср. сапожник, плотник, бондарь). Затем от прозвища Лубник по патронимической модели — то есть по имени отца — образовали фамилию Лубнина. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — «Лубнина», то есть дочь или вдова Лубника. В русской традиции фамилии на -ин чаще всего закреплялись за женщинами, если речь шла о вдове, или передавались по мужской линии в форме Лубнин, а Лубнина — это уже исторический женский вариант либо форма, закрепившаяся в документах.

Интересно, что фамилия эта довольно редкая. В отличие от массовых Лубенцовых или Лубяных, она сохранила архаичный суффикс и не перешла в более распространённые модели на -ов. Возможно, это указывает на северное или северо-восточное происхождение носителей: в тех краях патронимы на -ин дольше держались в крестьянской среде. В любом случае, предок носителей фамилии Лубнина был человеком, который умел работать с лубом — заготавливал его в липовых лесах или плёл из лыка короба и лапти.