Фамилия Луканькина образована от имени или прозвища Луканька. В основе лежит, скорее всего, производная форма крестильного мужского имени Лука. В переводе с латинского это имя означает «светоносный». Имя Лука — одно из древних христианских: апостол и евангелист Лука, по преданию, происходил из греческой семьи и считается первым иконописцем. Ему приписывают авторство нескольких икон Богородицы, в том числе Владимирской (сейчас в Третьяковской галерее), Ченстоховской и Киккской.

Суффикс -к- в форме Луканька — типичный для русской народной, обиходной речи. Такие уменьшительно-ласкательные варианты имён (Лука → Луканька) были широко распространены в повседневном общении, особенно в крестьянской и мещанской среде. От них и пошли фамилии на -ин: Луканькин, то есть «сын Луканьки» или «человек из семьи Луканьки».

Есть и другая версия происхождения. В русских говорах слово «лукавый» означало не только «хитрый», но и «изворотливый», «скрытный». Прозвище Луканька могло закрепиться за человеком с таким характером — не обязательно в отрицательном смысле, скорее как бытовая характеристика. В этом случае фамилия пошла не от имени, а от мирского прозвища.

Форма Луканькина — женская, в мужском варианте фамилия звучит как Луканькин. В документах и переписях такие фамилии фиксировались обычно по мужской линии, но в современном обиходе распространены обе формы.

Фамилия редкая: её носители встречаются в основном в центральных и северных областях России, где имя Лука было традиционно популярно. География бытования узкая, что говорит о происхождении из одного или нескольких близких родов, а не о массовом расселении.