Фамилия Лупир — одна из тех, что ставит исследователя перед выбором: слишком очевидная версия лежит на поверхности, но именно она чаще всего оказывается ложной. Самое простое — связать её с глаголом «лупить»: бить, колотить, а в диалектах — ещё и быстро есть или лущить. Тогда прозвище Лупир получил бы человек драчливый или, наоборот, тот, кого часто били. Такая версия напрашивается, но словообразовательный разбор заставляет в ней усомниться.

В русской модели фамилий суффикс -ир — редкость. Обычные форманты — -ов, -ин, -ский, -их. Суффикс -ир характерен для украинской и белорусской ономастики, особенно в фамилиях, образованных от названий профессий (слесарь — Слесар, швец — Швец, бондарь — Бондар). В этом ряду Лупир могло быть прозвищем мастера, занятого какой-то специфической обработкой. В южнорусских и украинских говорах «лупити» означает не только бить, но и сдирать кору, чистить кожуру, обдирать зерно. Соответственно, Лупир — это «обдирщик», человек, который занимался лущением, очисткой чего-либо. В условиях сельского хозяйства и ремесла такое занятие было конкретным и узнаваемым.

Есть и более узкая версия, связанная с географией. Фамилия Лупир встречается в документах по Подольской губернии и на западе Украины. Там слово «лупир» могло быть вариантом произношения «лупар» — от латинского lupus (волк) через польское или румынское посредство. В таком случае прозвище давали за волчьи повадки или внешность. Однако эта гипотеза слабее: переход «а» в «и» в безударном положении возможен, но не подтверждён массовыми примерами в этой фамилии.

Таким образом, наиболее правдоподобно, что родоначальник Лупиров получил своё прозвище по занятию: он лупил — сдирал кору с деревьев, обдирал зерно, чистил рыбу или кожу. Фамилия осталась в формах без типичного русского суффикса, что указывает на её западнорусское или украинское происхождение. Встречается она нечасто, и каждый её носитель хранит отголосок конкретного, почти утраченного ремесла.