Фамилия Лутин образована от прозвища или имени, которое в основе своей имеет два возможных источника. Первый — это производная форма крестильного имени Лука (от латинского «светоносный»), которое носил один из евангелистов и апостолов. В народной речи имя Лука часто преобразовывалось в Лутоха, а от него могли пойти и Лутины.

Но более правдоподобна версия, связывающая фамилию с нарицательным «луток» — вид утки или нырка. Такое прозвище — Луток или Лутя — могли дать человеку, который отлично плавал. В русских говорах слово «луток» бытовало именно в этом значении, и прозвище закреплялось за ловким пловцом или за тем, кто промышлял охотой на водоплавающую птицу.

Словообразовательная модель здесь простая: основа Лут- (от Луток или Лутя) плюс типичный русский фамильный суффикс -ин. Такие фамилии обычно указывали на принадлежность к главе семьи: «чей сын?» — Лутин, то есть сын Лути. Суффикс -ин характерен для фамилий, образованных от основ на -а/-я, что как раз подходит к прозвищу Лутя.

Интересная деталь: фамилия Лутин встречается преимущественно в северных и центральных регионах России, где водились нырковые утки, и где слово «луток» было в ходу. В ономастических источниках, например у Б. Унбегауна, такая модель рассматривается как типичная для прозвищ, связанных с птицами и водной стихией.

Таким образом, скорее всего, первый носитель фамилии Лутин — не просто потомок Луки, а человек, получивший прозвище за умение плавать, и это прозвище оказалось устойчивее церковного имени.