Фамилия Маганков — яркий пример того, как прозвище, данное человеку за манеру поведения, закрепилось в родовом имени. В её основе лежит древнерусское слово «магать» или «магнуть», означавшее «махать», «размахивать», «кивать» или «подавать знак». Соответственно, Маганком в старину могли прозвать человека, который энергично жестикулировал при разговоре, имел порывистые движения или, наоборот, часто кивал, подавая кому-то знаки. В некоторых говорах у этого слова был и другой оттенок — «обманывать, плутовать», поэтому не исключено, что прозвище могло закрепиться за хитрецом или ловкачом.

Словообразовательная модель здесь проста и прозрачна: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей сын?» — Маганков). Фамилия образована от прозвища Маганок, которое, в свою очередь, появилось с помощью уменьшительного суффикса -ок от глагольной основы «магать». Это типичный для русских фамилий путь: сначала человек получал меткое прозвище по действию или черте характера, а затем его дети и внуки наследовали это имя уже как фамилию.

Интересно, что фамилия Маганков имеет выраженную региональную привязку. По данным исторических документов, она встречается преимущественно в южнорусских областях, особенно на территории бывшей Рязанской губернии и в казачьих областях Дона. Это объясняется тем, что глагол «магать» был особенно распространён именно в южных и юго-восточных говорах. В северных и центральных регионах России чаще использовали слово «махать», поэтому там возникли фамилии Махаев, Махин или Махов, а не Маганков.

В отличие от многих фамилий, которые возводят к крестильным именам, Маганков — чисто прозвищная фамилия. В ней нет церковного следа, зато хорошо видна бытовая наблюдательность наших предков, которые замечали за человеком яркую привычку и превращали её в его второе имя. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» эта модель описывается как характерная для прозвищ, образованных от глаголов звукоподражательного или изобразительного характера.