Фамилия Магазинщикова — женская форма фамилии Магазинщиков, и в её основе лежит редкое для русского ономастикона слово «магазинщик». В отличие от распространённых «торговых» фамилий (Купец, Лавочников, Торговкин), эта образована не от названия владельца магазина, а от человека, который в этом магазине работал по найму. В XIX веке «магазинщиком» называли не столько купца-владельца, сколько приказчика, сидельца или продавца в казённой винной лавке или частной торговой точке. В словаре В. И. Даля это слово фиксируется именно в значении «продавец», а не «хозяин».

Модель образования типична для северных и сибирских говоров: суффикс -щик- (с чередованием к/ч: магазин — магазинщик) и далее фамильный суффикс -ов/-ев, который указывал на принадлежность: «сын магазинщика». Окончание -а в женском варианте — чисто грамматическое, для согласования с полом носительницы. Фамилия недворянская, скорее всего, мещанская или купеческая, но из низших слоёв купечества — от служащих, а не от владельцев капитала.

Географически фамилия тяготеет к Уралу и Западной Сибири. В переписях XIX века Магазинщиковы встречаются в Пермской и Тобольской губерниях — регионах, где активно развивалась винная торговля и казённые магазины. В центральных губерниях эта фамилия практически не фиксируется: там чаще использовали слово «лавочник» или «сиделец». Таким образом, Магазинщикова — не просто «фамилия торговца», а конкретный маркер: предок был наёмным продавцом в казённой или частной лавке, скорее всего, в Сибири или на Урале, во второй половине XVIII — начале XIX века.