Фамилия Магдюков — редкая. Её не встретишь в сотнях записей, и это сразу подсказывает путь: скорее всего, перед нами не массовая «географическая» фамилия от названия села, а прозвищная, возникшая в узком кругу. Чтобы понять её, нужно разобрать основу, а она неочевидна.

В русских фамилиях суффикс -ов указывает на принадлежность: «чей сын?» — Магдюков. Значит, в основе лежало личное имя или прозвище Магдюк. Само слово «Магдюк» не встречается в святцах, это не каноническое имя. Скорее всего, это диалектное или искажённое прозвище. Самая вероятная версия: оно восходит к тюркскому корню магды или магдут — в ряде тюркских языков это значит «рождённый», «появившийся на свет» (ср. татарское «магъди» — рождённый). В таком случае прозвище Магдюк могли дать младшему или долгожданному ребёнку — «поздний», «выпрошенный».

Есть и другая, менее вероятная версия. В некоторых говорах русского севера и Урала бытовало слово «магдырь» или «магдыр» — так могли называть неуклюжего, медлительного человека. Если предположить, что прозвище Магдюк — это усечённая форма от «магдырь», то фамилия могла закрепиться за потомками человека с такой характеристикой. Но эта версия слабее: «магдырь» — слово редкое и локальное, а тюркский след в фамилиях южнорусских и поволжских регионов встречается гораздо чаще.

Географически фамилия Магдюков тяготеет к зоне русско-тюркского пограничья: Башкирия, Татарстан, Оренбуржье. В метрических книгах XIX века единичные записи Магдюковых встречаются именно в Оренбургской губернии среди крестьян и отставных солдат. Это подтверждает версию о тюркском корне: в тех краях фамилии на «-юк» (Магдюк, Абдюк, Сардюк) нередко образовывались от тюркских личных имён с уменьшительным суффиксом.

Таким образом, Магдюков — фамилия прозвищная, скорее всего, от имени Магдюк («рождённый»), сформированная по стандартной русской модели «чей сын». Носители этой фамилии — потомки человека, которого в тюркоязычной среде или на стыке культур называли словом, означавшим «дитя», «поздний ребёнок». Фамилия редкая, и её сохранение — уже небольшая загадка: в отличие от массовых Ивановых, она не растворилась в статистике, а осталась маркером конкретной семейной истории.