Фамилия Магилюк образована от прозвища Магиль. В его основе лежит украинское слово «магіль» — «скалка», то есть круглая гладкая палка для раскатывания теста или белья. В старину скалками (катками) не только раскатывали тесто — ими пользовались вместо утюгов, выглаживая одежду. Скорее всего, прозвище Магиль получил человек, который профессионально занимался выравниванием и разглаживанием ткани. Потомки этого человека, работавшего с катком, и стали Магилюками.

Суффикс -юк указывает на западноукраинское происхождение фамилии. Такая модель типична для Волыни, Подолья и Галичины: суффикс -ук/-юк присоединяли к основе прозвища, чтобы обозначить «сына» или «потомка» носителя этого прозвища. Магилюк — буквально «сын Магиля», «потомок того, кого прозвали Скалкой».

Другие версии происхождения основы маловероятны. В украинском языке слово «магіл» имеет только одно прямое значение — «скалка», а родственных фамилий (Магиль, Магильчук, Магильченко) немного, и все они держатся в пределах западных областей Украины. Это говорит о том, что прозвище было локальным и бытовым, а не заимствованным из других языков.

Сословной привязки у фамилии нет: ремесло выглаживания одежды могли освоить и крестьяне, и мещане. В документах фамилия встречается редко, что неудивительно для узкопрофессионального прозвища, которое не превратилось в массовую фамилию.