Фамилия Маглышева — женская форма фамилии Маглышев. Её основа, скорее всего, восходит к прозвищу или имени Маглыш. Это слово в русских говорах могло означать «коротышка», «невысокий, плотный человек» (от диалектного «маглый» — малорослый, приземистый). В словаре Владимира Даля «маглый» фиксируется именно с таким значением: низкорослый, небольшой. Таким образом, первый носитель фамилии получил прозвище по внешнему признаку — за невысокий рост или коренастое телосложение.

Суффикс -ыш в основе типичен для русских прозвищ, образованных от прилагательных: ср. «малый» → Малы́ш, «глупый» → Глупы́ш. В фамилии Маглышев мы видим ту же модель: прилагательное «маглый» + суффикс -ыш (Маглыш) + патронимический суффикс -ев, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Маглыша). Форма Маглышева, соответственно, означает «дочь или жена Маглышева».

Фамилия редкая, географически привязана в основном к центральным и южнорусским областям, где бытовало слово «маглый». Встречается в документах XVII–XVIII веков, например, в переписных книгах Курского края упоминаются крестьяне Маглышевы. Сословно фамилия, скорее всего, крестьянская или посадская, без связи с дворянскими родами. В современной России фамилия остаётся малочисленной, что делает её хорошим маркером для генеалогического поиска: если вы носите фамилию Маглышева, ваши предки почти наверняка жили в зоне распространения южновеликорусского говора.