Фамилия Магомадова хранит память о личном имени предка, а точнее — о его диалектном варианте. В основе лежит мужское тюркское имя Магомад, которое представляет собой местную, упрощённую форму арабского имени Мухаммет (Мухаммад). В переводе с арабского оно означает «восхваляемый» или «прославляемый». Выбор такого имени был не случайным: родители, называя сына Магомадом, желали ему вырасти достойным мусульманином и тем самым вверяли его покровительству пророка.

Фамилия образована по стандартной русской патронимической модели с суффиксом -ов, который в данном случае присоединяется к основе Магомад. Эта модель («чьего сына?» — Магомадова) была усвоена многими народами Кавказа и Поволжья в процессе административного учёта населения в XIX–XX веках. Таким образом, первоначальное значение фамилии — «потомок Магомада».

Интересно, что фамилия Магомадова — один из примеров того, как имя пророка (в разных фонетических вариантах) дало начало целому ряду родственных фамилий у разных народов: Магомедов, Магомедов, Маматов, Мамедов. Но именно форма Магомад характерна для определённых тюркских диалектов, что может указывать на конкретный регион происхождения рода — например, на кумыкскую или ногайскую среду. Передаваясь из поколения в поколение, фамилия по сей день хранит память о том, какое имя носил основатель рода и какое значение ему придавали.