Фамилия Магомед — один из немногих случаев, когда фамилия совпадает с личным именем, причем имя это — не календарное, а широко распространённое у народов Кавказа и Поволжья. В русской традиции такое явление называют «фамилией-тезкой»: её носил предок, которого в документах записали просто по имени, без типичного русского суффикса.

Основа здесь — арабское имя Мухаммад (محمد), что значит «восхваляемый», «достойный хвалы». В языках народов Дагестана, Чечни, Ингушетии, а также у татар и башкир это имя закрепилось в форме Магомед (с ударением на последний слог). Именно в таком виде — без добавления -ов, -ев или -ин — фамилия и вошла в официальные документы. Это говорит о том, что формирование фамилии происходило уже в советское время, когда при паспортизации горцев имя могли записать как фамилию, не переделывая её на русский лад.

По сути, фамилия Магомед — это «застывшее» личное имя. Предок носителя, скорее всего, был аварцем, даргинцем, кумыком или чеченцем, которого в метриках или сельсовете записали просто как «Магомед». В отличие от русских крестьянских фамилий, где суффикс указывал на принадлежность («чей сын?»), здесь модель образования нулевая: имя стало фамилией напрямую.

Интересно, что в той же среде бытуют и «русифицированные» варианты — Магомедов, Магомедов. Фамилия без суффикса встречается реже и часто указывает на более позднюю фиксацию или на то, что носитель происходит из местности, где отчество и фамилия не различались вплоть до середины XX века. Географически она привязана в основном к Дагестану, Чечне и, реже, к татарским селам.

В ономастических справочниках фамилия Магомед обычно не разбирается отдельно от фамилии Магомедов, так как обе восходят к одному корню. Но разница в окончании — не случайность, а маркер истории документа: если Магомедов — это классическая русская модель (чей? — Магомедов), то Магомед — это прямая запись имени без переоформления, что для кавказского региона вполне нормально.