Фамилия Магусева, на первый взгляд, звучит непривычно для русского уха — и это подсказка. Скорее всего, перед нами не исконно славянская фамилия, а русифицированная форма, принесённая на территорию России переселенцами или присоединёнными народами. Основа «Магус» или «Магусев» явно восходит к личному имени Маг, которое у разных народов имеет разное происхождение. Самая вероятная версия — тюркская или кавказская. У народов Северного Кавказа (например, у осетин, ингушей, чеченцев) имя Маг или его производные означало «святой», «священный», «посвящённый» — от арабского «маг» (святой, праведник). В таком случае фамилия Магусева — это матроним или патроним, образованный от имени Магус (Маг + суффикс принадлежности -ус, характерный для некоторых кавказских языков), а затем к нему добавили русский суффикс -ев, обозначающий «чей?» — «сын Магуса» или «из рода Магусовых».

Вторая, менее распространённая версия — связь с древнеперсидским словом «магу» (жрец, маг). В русском языке слово «маг» известно, но фамилия Магусева могла бы тогда быть искусственной, книжной — например, у потомков священнослужителей, получивших семинарскую фамилию от латинского «magus» (волхв). Однако в реальных исторических документах такая фамилия почти не встречается у духовенства — чаще её фиксируют на Кавказе и в Поволжье.

Суффикс -ев указывает на то, что фамилия была оформлена по русской модели в XIX–XX веках, когда многие нерусские фамилии «обрусевали» для паспортов и метрик. Поскольку фамилия женского рода (Магусева), её мужской вариант — Магусев. Встречается фамилия редко, преимущественно в республиках Северного Кавказа (Ингушетия, Чечня, Северная Осетия) и среди потомков переселенцев в центральной России. Носители фамилии, скорее всего, происходят из среды, где давали имена с религиозным или почётным значением — то есть из мусульманских или христианских общин, где ценилась святость имени. Точных данных о знаменитых носителях нет — фамилия остаётся локальной и малоизученной.