Фамилия Макаков — хороший пример того, как в русской ономастике простое прозвище превратилось в фамилию, обросло суффиксами и закрепилось в документах. Главный вопрос, который возникает при первом взгляде: «Макак» — это обезьяна? Ответ: и да, и нет.

Самый прямой путь словообразования — от прозвища Макак. В русских говорах, особенно в южных и центральных областях, словом «макака» или «макак» могли называть не только обезьяну, но и человека с необычной внешностью: кривляку, гримасника, того, кто «строит рожицы». Прозвище давали за манеру поведения — например, за привычку передразнивать других. Такое прозвище могло быть не обидным, а скорее уличным, описательным. Позже к основе «Макак» добавился патронимический суффикс -ов, который в русских фамилиях отвечал на вопрос «чей?»: Макаков — сын Макака.

Однако есть и вторая, более вероятная версия, связанная с крестильным именем. Дело в том, что фамилия Макаков могла возникнуть из уменьшительной формы имени Макарий. В народной речи имя Макарий (греч. makarios — «блаженный», «счастливый») сокращали до Мака́р, а от него образовывали ласкательные варианты: Макака, Макак. Тогда Макаков — это не «сын обезьяны», а «внук Макара» или «сын Макаки» (в значении «маленький Макар»). Такая модель — переход от уменьшительного имени к фамилии — в русской ономастике встречается постоянно: ср. Тимоха → Тимохов, Миня → Минев, Кузя → Кузин.

Спор двух версий разрешается просто: обе имеют право на существование, и без генеалогического исследования конкретной семьи сказать, какая сработала, невозможно. Но если смотреть на частотность — фамилия Макаков редкая. Она не входит в списки сотен самых распространённых русских фамилий, а значит, скорее всего, возникла в одном или нескольких локальных гнёздах. Географически её можно встретить в Поволжье и на Урале — в тех областях, где имя Макар было особенно популярно среди крестьян и мещан.

Интересная деталь: в отличие от фамилии Макаров (от полной формы имени), Макаков — это след именно уменьшительного, «домашнего» варианта. Такие фамилии часто носили люди, чьи предки в быту звались не официальным именем, а ласковым или прозвищным. То есть Макаков — фамилия, которая хранит в себе не столько профессию или сословие, сколько интонацию семейного общения.