Фамилия Макаронинский — редкий пример, когда основа настолько прозрачна, что вызывает недоверие. Самый очевидный и, скорее всего, верный корень — «макароны». Однако не спешите представлять предка-итальянца или повара. В русской ономастике прозвище Макарон мог получить не любитель пасты, а человек с длинным, худым телосложением (как макаронина) или, по ироничной народной логике, тот, кто был замешан в какой-то истории с макаронами — например, торговал ими или, наоборот, воровал их с барского стола. В любом случае, прозвище бытовое, скорее всего, насмешливое.

Главная особенность — суффикс -инский. В польской и западнорусской традиции (особенно на территории бывшей Речи Посполитой) этот суффикс часто присоединяли к прозвищам и названиям профессий, создавая фамилии по модели «чей?» или «откуда?». Макаронинский — это «сын Макарона» или «человек из рода Макаронов». Если бы фамилия образовалась в центральной России, она звучала бы как Макаронов. Форма на -инский указывает на шляхетский или мещанский круг, а также на возможное происхождение из западных губерний Российской империи (современные Беларусь, Украина, Смоленщина).

Менее вероятная, но лингвистически возможная версия — топонимическая. Фамилия могла произойти от названия деревни или хутора Макаронино, Макароны (такие названия встречаются, хоть и редко). В таком случае Макаронинский — это помещик или выходец из этого места. Однако отсутствие широко известных географических объектов с таким корнем делает эту версию вторичной.

Однокоренные фамилии — Макаронов, Макаронников — встречаются чаще и однозначно указывают на ремесло. Макаронинский же стоит особняком. Его редкий суффикс и нестандартная основа делают фамилию «говорящей»: она сразу выдаёт прозвищное происхождение, а не профессиональное. Носитель такой фамилии, скорее всего, потомок не мастера-макаронщика, а человека, которого окружающие запомнили по какой-то бытовой черте или случаю.

Сословно фамилия не маркирована. Поскольку она образована через суффикс -ский, её могли носить как мелкие дворяне (получившие фамилию по имению), так и духовенство (семинарские фамилии), но в случае с прозвищной основой «макарон» это, скорее, поздняя фамилия мещан или однодворцев. Точных данных о массовом распространении фамилии в архивах нет — она относится к числу редких, штучных.