Фамилия Махутин образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Прозвище Махута, возможно, восходит к слову «махут», которое с иврита переводится как «суть». Согласно этому, можно предположить, что основатель рода Махутиных был рассудительным, степенным человеком, который старался во всем разобраться. Нельзя исключать, что в основе этого прозвища лежит турецкое слово mahut - «пресловутый», в значении «приобретший печальную известность, пользующийся дурной славой, дурной репутацией». В таком случае, Махутой могли называть человека, который стал знаменит благодаря не очень хорошему поступку. Менее вероятна связь прозвища Махута и эстонского слова mahutus - «вместительный». Тогда прозвище Махута мог получить полный человек. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Махута, со временем получил фамилию Махутин. О точном месте и времени возникновения фамилии Махутин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Махутин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.