Фамилия Магутины — одна из тех, где за основу взяли не имя, а прозвище. В старину словом «могута» (или «магута» в акающих говорах) называли силу, мощь, богатство и достаток. Так могли прозвать человека властного, материально обеспеченного или просто физически крепкого, с отменным здоровьем. Чередование гласных о/а в корне — обычное дело для русских говоров, особенно тех, где «акают»: произносили «магута», а писали потом «Магутин».

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Магутин — это «сын Магуты» или «человек из рода Магуты». Модель образования типична для русских фамилий, но сама основа встречается не так часто, как, скажем, Иванов или Петров, что делает фамилию заметной.

Ономастические источники фиксируют родственные фамилии. В работах С. Веселовского упоминаются Могутовы: Гридя Могутов, крестьянин конца XV века из Костромы, и Матвей Могутов, писец 1575 года из Арзамасского уезда. Эти ранние записи подтверждают, что прозвище бытовало в центральной России уже несколько столетий назад. Точное место возникновения фамилии Магутин сейчас определить сложно — процесс формирования фамилий был долгим, и одна и та же фамилия могла независимо появиться в разных регионах. Однако ясно, что предки современных Магутиных получили своё родовое имя от человека, которого окружающие выделяли за силу, власть или богатство.