Фамилия Макшанихин — редкий пример «матронимической» модели, то есть образованной не от имени или прозвища отца, а от имени матери. В русской традиции такие фамилии встречаются нечасто и обычно возникали, если женщина после смерти мужа вела хозяйство одна или её личность в семье была весомее, чем у супруга. Суффикс -их- (в форме родительного падежа множественного числа) указывает на принадлежность: Макшаниха — это женщина, которую в деревне называли по её собственному имени или прозвищу Макшана, а её дети становились «Макшанихиными», то есть «те, кто из дома Макшанихи».

Основа фамилии — личное имя или прозвище Макшана. Оно восходит к каноническому имени Максим (от латинского maximus — «величайший»), но в народной речи приобрело уменьшительно-ласкательную форму. В северных и сибирских говорах такие усечённые варианты с суффиксом -ан(а) были обычны: Макшана, Савана (от Савва), Вана (от Иван). Таким образом, Макшанихин буквально означает «сын (или потомок) Макшаны».

Географически фамилия тяготеет к регионам, где была распространена модель на -ихин, — это прежде всего Северное Поволжье, Вятка, Урал и Сибирь. В этих местах «матронимические» фамилии встречаются чаще, чем в центральной России. В современных базах данных Макшанихины фиксируются в Пермском крае, Кировской области и на юге Тюменской области — то есть в зоне позднего заселения русскими, где старые родовые традиции смешивались с новыми.

Интересно, что фамилия Макшанихин сохранила архаичный суффикс -их-, который в большинстве других регионов вытеснялся более продуктивными -ов и -ин. В ономастике это называют «семейно-родовым» типом: он указывал не на конкретного отца, а на целую семейную группу, «гнездо», которое называли по старшей женщине. Такая модель — живое свидетельство того, что в русской деревне XVIII—XIX веков статус вдовы или хозяйки дома мог быть настолько высок, что её имя становилось основой для фамилии всех домочадцев.