Фамилия Малофеев образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Малофеев послужило мирское имя Малофей. Фамилия Малофеев образована от церковного мужского имени Малахий, что в переводе с древнееврейского означает «посланник мой». Основой же для фамилии послужила его просторечная форма Малафей (в «окающих» говорах - Малофей). Таким образом, потомок человека, обладающего именем Малофей, со временем получил фамилию Малофеев. О точном месте и времени возникновения фамилии Малофеев в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Малофеев представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.