Фамилия Малофейкин — редкий и яркий пример того, как в русской фамилии сталкиваются церковная традиция и бытовое просторечие. В её основе лежит имя Малофей, которое является народной, «облегчённой» формой крестильного имени Мефодий. В греческом оригинале Мефодий означает «методичный», «следующий порядку», но в русских говорах имя быстро переделали на более привычный лад, заменив начальное «Ме» на «Ма» и упростив концовку. Так появился Малофей — звучание, которое могло ассоциироваться и с прилагательным «малый» (маленький), хотя прямая связь здесь не этимологическая, а народно-переосмысленная.

Фамилия построена по продуктивной модели: имя Малофей → суффикс -к- (уменьшительно-ласкательная форма Малофейка) → притяжательный суффикс -ин. Таким образом, Малофейкин буквально означает «чей?» — сын или потомок Малофейки. Суффикс -ин в русских фамилиях типичен для основ, оканчивающихся на -а или -я, и указывает на принадлежность к конкретному человеку. А вот суффикс -к- в имени-основе (Малофейка) выдаёт неофициальную, домашнюю среду: так называли человека в семье или в деревне, в отличие от полного церковного Мефодий.

Географически фамилия тяготеет к центральным и северным регионам России, где были распространены подобные «простые» формы крестильных имён. Встречается она нечасто, что говорит о локальном бытовании прозвища или имени в конкретной местности. По сословной принадлежности носители — скорее всего, крестьяне или мещане, поскольку фамилии на -ин с основой от обиходной формы имени типичны для непривилегированных слоёв населения, где не стремились к «благородному» звучанию на -ов или -ский.

Любопытно, что фамилия Малофейкин не имеет ничего общего со словом «малофеев» (от Малафей, тоже народная форма Мефодия) или «малафеев» (от имени Малахия). Это самостоятельный ономастический вариант, сохранивший именно суффиксальную цепочку -к-ин, что делает его более «домашним» по сравнению с однокоренными Малофеевыми. Если ваш предок звался Малофейкиным, он, скорее всего, происходил из семьи, где деда или отца в быту звали Малофейкой — и это имя закрепилось как родовое клеймо.