Основой фамилии Мальцов послужило мирское имя Малец. В семьях маленького ребенка часто называли просто Мальцом, Малютой, Малышом. И даже когда ребёнок становился взрослым, он по-прежнему носил детское имя Малец, которое впоследствии закрепилось в фамилии. Согласно другой гипотезе, фамилия Мальцов восходит к прозвищу Малец, которое указывало на особенности внешности человека, а именно — невысокий рост. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Малец, со временем получил фамилию Мальцов.