Основой фамилии Малушин послужило мирское имя Малуша. Фамилия Малушин, вероятно, образована от распространённого в старину мирского имени Малуша, котороеобразовано от основы «мал-» - «маленький». В семьях маленького ребенка часто называли просто Мальцом, Малютой, Малышом, Малушей. И даже когда ребёнок становился взрослым, он по-прежнему носил детское имя Малуша, которое впоследствии закрепилось в фамилии. Имя Малуша носила младшая из двух жен Святослава I Игоревича, великого князя киевского и всей Руси, дочь любчанина (жителя города Любеча) Малка, или Мальца. Великий князь Святослав взял ее за себя, когда она была ключницей его матери, святой Ольги, и имел с ней только одного сына, князя Владимира. Считается, что Добрыня, по крестному отцу Никитич, славный богатырь и воевода Владимиров был родным братом Малуши. Согласно другой гипотезе, фамилия Малушин восходит к прозвищу Малуша, которое указывало на особенности внешности человека, а именно — невысокий рост. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Малуша, со временем получил фамилию Малушин.