Фамилия Малушина — одна из тех, что напрямую связана с древнерусскими мирскими именами. Её основа — имя Малуша, которое в старину давали ребёнку в семье, подчёркивая его маленький возраст или невысокий рост. В быту детей часто называли Мальцом, Малютой, Малышом — и Малуша была таким же ласковым прозвищем, которое могло закрепиться за человеком на всю жизнь. С течением времени это имя перешло в фамилию по модели с суффиксом -ин, указывающим на принадлежность: «чей?» — Малушин, то есть сын или потомок Малуши.

Суффикс -ин типичен для русских фамилий, образованных от имён и прозвищ на -а/-я. В данном случае он не несёт дополнительной смысловой нагрузки, а лишь оформляет родовую принадлежность. Сама основа «мал-» — прозрачна и встречается во множестве однокоренных фамилий: Малышев, Мальцев, Малютин. Но Малушина стоит особняком: она восходит не к прилагательному, а к конкретному личному имени, которое было в ходу в домонгольской Руси.

Самое известное упоминание Малуши — историческое. Малуша была младшей женой великого князя киевского Святослава I Игоревича, дочерью любчанина Малка. До замужества она служила ключницей у княгини Ольги, матери Святослава. От этого брака родился князь Владимир — будущий креститель Руси. А её братом, по преданию, был Добрыня Никитич, знаменитый воевода и былинный богатырь. Таким образом, имя Малуша засветилось в самой гуще древнерусской истории, и фамилия Малушина может косвенно нести отзвук этой родословной, хотя в большинстве случаев она, конечно, возникала независимо — как обычное отчество от мирского имени.

Вторая версия происхождения — от прозвища Малуша, данного взрослому человеку за низкий рост. Такое прозвище было не обидным, а описательным: в крестьянской среде внешние особенности часто становились основой для семейного прозвания. В этом случае фамилия Малушина — типичный пример того, как прозвище, данное одному предку, закрепилось за целым родом.

Географически фамилия Малушина встречается в центральных и северных областях России, где были сильны традиции мирских имён. В документах XVI–XVII веков можно найти упоминания крестьян и посадских людей с такой фамилией, но массового распространения она не получила — это редкая, «штучная» фамилия, что делает её особенно ценной для семейной истории.