Фамилия Малынина — женская форма, а её основа — мужская фамилия Малынин. Разберёмся, откуда она взялась. Модель образования здесь классическая для русского севера и центра: суффикс -ин указывает на принадлежность. Малынин — значит «сын Малыни» или «человек из рода Малыни». Сама основа Малыня — это не имя, а прозвище. В русских говорах «малыня» могло означать маленького, невысокого человека, либо младшего в семье — этакого «малыша». В некоторых диалектах слово имело и ласкательный оттенок, как «малышок», «малюточка». Так что первый носитель фамилии, скорее всего, был невысок ростом или был самым младшим сыном.

Есть и вторая, менее распространённая версия. В ряде регионов «малыня» — это вид рыбы, мелкий снеток или малёк. Тогда прозвище мог получить рыбак, промышлявший такой рыбой, или просто человек, которого сравнивали с мелкой рыбёшкой за худобу или незначительность. Но первая версия — антропонимическая, от роста или возраста — встречается чаще и надёжнее.

Географически фамилия Малынин (и её женская форма) привязана к центральным и северным областям России, особенно к Вологодчине, Костромской и Ярославской землям. Там суффикс -ин в отпрозвищных фамилиях — норма, а слово «малыня» бытовало в живой речи. В южнорусских регионах, где предпочитали суффиксы -ов/-ев, такая фамилия встречается реже.

Интересная деталь: фамилия Малынина — не путать с Малышевой. У них разная основа. Малышев идёт от «малыш», а Малынин — от «малыня». Разница в суффиксе прозвища: -ыш против -ын(-ин). Это разные словообразовательные гнёзда, хотя по смыслу они близки. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна или В. Никонова) Малынин обычно идёт как отдельная единица, редкая по сравнению с массовой Малышевой. Социальный срез: носители Малыниных — чаще крестьяне или посадские люди, не дворяне. Фамилия не аристократическая, а народная, бытовая, что подтверждается её прозрачной семантикой.

Если говорить о носителях, то в открытых источниках известных исторических личностей с такой фамилией нет — это рядовая русская фамилия, каких тысячи. Но её ценность именно в этой простоте: она прямо говорит о предке — невысоком, младшем или, может, ловком рыбаке.