Фамилия Малыйкина — женская форма фамилии Малыйкин, и её разбор стоит начать с суффикса, который сразу выдает способ образования. Модель на -ин (-ын) в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей сын?» — Малыйкин, то есть сын Малыйки. В мужском варианте суффикс -ин сохраняется, а в женском добавляется окончание -а. Это одна из самых распространённых моделей в центральной и северной России, в отличие от южных и западных областей, где чаще встречались фамилии на -енко или -ук.

Основа фамилии — прозвище Малыйка. Уменьшительно-ласкательная форма «Малый» в русских говорах означала не только маленького ростом, но и младшего в семье, младшего сына или даже подростка. В старину прозвище Малой или Малый получал не обязательно низкорослый человек — так могли назвать младшего брата, чтобы отличать от старших. Суффикс -к- в основе (Малый → Малыйка) придаёт оттенок ласкательности или, наоборот, пренебрежения, в зависимости от контекста. В ономастике такие формы нередко закреплялись как фамилии, особенно если человек был известен в общине именно под этим домашним именем.

С географической точки зрения фамилия Малыйкина (и Малыйкин) тяготеет к регионам, где была сильна традиция прозвищных фамилий на -ин. По данным современных исследований, наибольшая концентрация носителей встречается в Поволжье, особенно в Нижегородской и Кировской областях, а также в Удмуртии. Это совпадает с ареалом бытования фамилий от уменьшительных форм личных имён и прозвищ.

Интересная деталь: в некоторых говорах «малыйка» могло означать не только человека, но и предмет — например, небольшой сосуд или меру сыпучих тел. Однако эта версия менее правдоподобна: прозвища от названий бытовых предметов обычно имеют более прозрачную мотивацию (Бочка, Ковш), а здесь основа явно восходит к прилагательному «малый». Спорных гипотез у этой фамилии немного, и самая прямая — от прозвища младшего члена семьи — остаётся основной.

В дореволюционной России фамилии на -ин чаще принадлежали крестьянам и мещанам, реже — дворянам (которые предпочитали модели на -ский или -ов). Так что предки носительницы фамилии Малыйкина, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми, и их родоначальник носил простое, но точное прозвище — Малыйка.