Фамилия Малыкина образована от прозвища Малыка. В русских семьях маленького ребенка могли ласково называть Малой, Малец или Малыка — так родители выделяли младшего сына или просто самого маленького в доме. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Малыкина буквально значит «дочь (или жена) Малыки». Это типичная модель для русских фамилий, где основа — личное прозвище, а окончание отвечает на вопрос «чей?».

Интересно, что прозвище Малыка могло закрепиться не только за ребенком. В северных и сибирских говорах «малыка» иногда называли невысокого ростом взрослого человека, а в некоторых диалектах — младшего по положению работника в артели. Поэтому фамилия могла возникнуть в разных социальных слоях независимо друг от друга.

Самый известный носитель фамилии — Роман Яковлевич Малыкин, врач и ученый начала XX века. Он начинал в клинике Владимира Бехтерева в Психоневрологическом институте в Ленинграде, затем работал в клинике нервных и душевных болезней на медицинском факультете Донского государственного университета. Именно там сформировалось его клинико-физиологическое направление. Малыкин написал около ста научных работ — по тем временам солидный вклад в неврологию.

С точки зрения словообразования фамилия Малыкина стоит в одном ряду с более частотными Малышев, Мальцев и Малыхин. Разница в суффиксах: -ев и -ин — это региональные и хронологические варианты одной модели. Малыкина — форма женского рода, но в современном бытовании она закрепилась за женщинами как неизменяемая фамилия, а мужской вариант — Малыкин.