Фамилия Малыкин, скорее всего, была образована от ласкательного прозвища Малыка, которое родители дали ребенку. В семьях ребенка часто называли просто Малой, Малец или Малыка. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Малыка, со временем получил фамилию Малыкин.