Фамилия Малыковы — одна из тех, где на первый взгляд всё прозрачно, но при ближайшем рассмотрении открывается несколько разных путей происхождения. Самый прямой и лежащий на поверхности вариант — от мирского имени или прозвища Малой, Малец или Малык. В крестьянской среде ребёнка могли запросто называть по росту или возрасту: «малый» значило «маленький», и такое именование часто закреплялось как семейное. Отсюда же пошли однокоренные фамилии Малых, Малёк, Малышев — все они из одного гнезда.

Менее очевидная, но тоже возможная версия связывает фамилию с просторечной формой канонического имени Малахия. Это древнееврейское имя переводится как «посланник мой», а в народном произношении оно нередко превращалось в Малах, Малаш или Малык. В пользу этой гипотезы говорит то, что на Руси нецерковные имена часто совпадали по звучанию с сокращёнными формами крестильных, и путаница была обычным делом.

Корень «мал-» в русских фамилиях даёт богатую словообразовательную модель. Здесь работает суффикс -ов, указывающий на принадлежность: Малыков — буквально «сын Малыка». Такая модель была одной из самых продуктивных в XV–XVII веках, когда фамилии только начинали закрепляться за родами.

Что касается географии, фамилия Малыковы встречается в разных регионах, но заметна её концентрация в центральных и северных губерниях России, особенно в Вологодской, Костромской и Вятской областях. Там прозвища по внешним признакам были особенно распространены, и «Малой» мог получить своё прозвище не только за рост, но и как младший сын в семье.

Точное время возникновения фамилии Малыков установить сложно — процесс формирования русских фамилий растянулся на несколько столетий. Однако можно уверенно сказать, что она относится к древнему пласту славянских родовых имён, где за каждым прозвищем стоит живая бытовая история: рост, возраст, семейное положение или даже просто ласкательное обращение.