Фамилия Манафов образована от тюркского мужского имени Манаф, которое означает «высоко стоящий». Вероятно, родители, нарекая своего ребёнка таким именем, надеялись, что в будущем их сын достигнет высокого социального статуса. Из однофамильцев знаменит актёр Народный артист Азербайджана Фахраддин Манафов.