Фамилия Манаковский — классический пример польско-белорусской модели образования через суффикс -ский. В отличие от великорусских фамилий на -ов/-ев, которые указывали на отчество или принадлежность хозяину, фамилии на -ский в Речи Посполитой чаще всего давали по названию имения или местечка. Манаковский — тот самый случай: предок был либо владельцем, либо уроженцем села или хутора с названием вроде Манаково, Манаковичи или Манаков.

Корень «Манак» — спорный. Первая версия: это прозвище от диалектного «манак» — так в некоторых говорах называли льстеца, угодника или болтуна. Вторая версия: тюркское происхождение. Слово «манак» встречается в тюркских языках в значении «поросёнок» или «детёныш», а в южнорусских степях и на границе с Диким полем такие прозвища давали нередко — не столько для оскорбления, сколько для отличия человека по внешности или повадкам. Однако есть и третья, самая прозаичная: основа могла восходить к личному имени Манак — уменьшительной форме от Эммануил или Манассия. В украинских и белорусских метриках XVII–XVIII веков имя Манак фиксируется как самостоятельное.

Географически фамилия Манаковский плотно привязана к западным губерниям Российской империи — Витебской, Минской, Гродненской. После разделов Польши многие шляхтичи и однодворцы с такой фамилией попали в списки дворянства, но не все: часть носителей была крестьянами, получившими фамилию по месту жительства при отмене крепостного права в 1860-х. В современной России фамилия встречается редко, в основном на юге и в Сибири — результат переселений конца XIX — начала XX века.

Интересная деталь: в польском написании фамилия часто выглядит как Manakowski, а в дореволюционных документах встречается вариант Манаковскiй. Двойное «к» в корне — не ошибка, а следствие того, что в польской орфографии «k» перед суффиксом -ski не смягчается. В русском языке это сохранили, поэтому фамилия звучит твёрже, чем, скажем, Манаков.