Фамилия Мананикова — женская форма фамилии Манаников, и её разбор стоит начать с суффикса. Суффикс -ов- указывает на типичную русскую патронимическую модель: так образовывали фамилии от имени или прозвища отца. В данном случае основа — Мананик, а не напрямую «Манана» или «Мананя». Форма Мананик — это, скорее всего, прозвищное имя, образованное с помощью уменьшительно-ласкательного суффикса -ик. То есть Мананик — это «маленький Мананя» или «сын Манана».

Корень «Манан-» — самый спорный и интересный элемент. В русской ономастике он не связан с каким-либо распространённым крестильным именем. Правдоподобнее всего версия, что в основе лежит диалектное или просторечное слово «мана» — в некоторых говорах так называли обман, приманку, а также суетливого или несерьёзного человека. Прозвище Мананя мог получить тот, кто любил приврать, хитрил или, наоборот, был легкомысленным. В этом случае Мананиковы — потомки человека по прозвищу Мананя, а фамилия закрепилась уже от его сына, которого звали Мананик.

Менее вероятна, но не исключена связь с тюркскими корнями. В татарском и башкирском языках есть имя Манаф (от арабского «высокий, достойный»), но переход Манаф → Манан → Мананик фонетически неочевиден и требует натяжек. Скорее всего, фамилия имеет чисто русское, бытовое происхождение.

Географически фамилия Манаников встречается нечасто, но заметна в Поволжье и центральных областях России — в Самарской, Нижегородской, Пензенской губерниях. Это указывает на крестьянскую или мещанскую среду: фамилии на -ов с прозвищной основой характерны для непривилегированных сословий, где ремесло или черта характера легко становились семейным именем.

Таким образом, предки носительницы фамилии Мананикова — скорее всего, крестьяне или посадские люди, чей родоначальник получил прозвище Мананя за хитрость или суетливость, а его дети уже стали писаться Мананиковыми. Фамилия редкая, с живой диалектной основой.