Фамилия Манайчева — один из тех случаев, когда на первый взгляд прозрачная основа скрывает за собой несколько возможных путей происхождения. Чтобы разобраться, стоит начать с того, как именно образована эта фамилия. Суффикс -ев указывает на принадлежность к роду (чей? — Манайчев), а значит, в основе лежит личное имя или прозвище Манай, Манайка или Манайч. Ударение, вероятнее всего, падает на второй слог: Мана́йчева.

Самая прямая и правдоподобная версия — связь с тюркским именем Манай. В татарском, башкирском и казахском языках имя Манай (или Манайбек) восходит к слову «ман» — «родинка, метка», а в переносном смысле — «отмеченный, особенный». Встречается оно и в старых русских документах: например, в XVI–XVII веках среди служилых татар и касимовских мурз фиксировались люди с именем Манай. Если предок Манайчевых был крещёным татарином или выходцем из ордынской знати, фамилия могла закрепиться именно от этого имени.

Однако не исключена и чисто русская, прозвищная версия. В северных и вологодских говорах слово «манай» или «моня» означало «увалень, нерасторопный человек», а в псковских — «обманщик, плут». Глагол «манать» (обманывать, хитрить) дал бы прозвище Манай. В этом случае фамилия Манайчева — отчество от такого прозвища, причём суффикс -ч- (Манайч → Манайчев) характерен для кратких, обиходных форм имени: Манайч — это «сын Маная» или «маленький Манай». Такая модель встречается в севернорусских и сибирских фамилиях (сравните: Тимоха — Тимохин, но Тимоша — Тимошин; здесь форма Манайч даёт именно Манайчев).

География бытования фамилии тоже подсказывает ответ. По данным современных телефонных справочников и архивов ЗАГС, Манайчевы чаще всего встречаются в Татарстане, Башкортостане, Удмуртии и в Кировской области. Это как раз зона активных русско-тюркских контактов, где смешивались крещёные татары, марийцы и русские переселенцы. Тюркская версия здесь выглядит более весомой: имя Манай в этих краях было распространено, а прозвищное значение «обманщик» вряд ли прижилось бы как фамилия в среде, где все друг друга знали.

Редкий суффикс -ев при основе на -й (а не на твёрдый согласный) тоже обращает на себя внимание. Обычно фамилии от имён на -ай, -ей образуются через -ев: Манай → Манаев, но здесь мы видим Манай-ч-ев. Это означает, что исходной формой было не просто имя Манай, а его уменьшительно-ласкательный вариант Манайч (как Ваня — Ванич, Коля — Колич). В русской ономастике такая модель считается архаичной и характерна для фамилий, сформировавшихся до XVIII века, когда в быту активно использовались краткие формы имён.

Таким образом, семья Манайчевых с высокой вероятностью происходит от человека по имени Манай (возможно, крещёного татарина или башкира), которого в обиходе звали Манайч. Фамилия закрепилась в XVI–XVII веках в районах Поволжья и Прикамья, где тюркские имена свободно входили в русский обиход. Альтернативное прозвищное происхождение от диалектного «манай» (обманщик) не исключено, но менее вероятно — слишком уж устойчива географическая привязка к тюркскому ареалу.