Фамилия Манчурин — редкий случай, когда корень слова не оставляет сомнений в географическом происхождении, но ставит вопросы о пути, которым это слово попало в русскую фамильную систему. Основа — «манчур», то есть «маньчжур». В русском языке XVIII–XIX веков название народа и региона «Маньчжурия» писалось через «ч» и с одним «ь»: «Манчжурия», «манчжур». Фамилия Манчурин — это притяжательное прилагательное с суффиксом -ин, указывающее на родство: «чей?» — «манчжуров», то есть сын или потомок человека, которого в округе звали Манчуром.

Почему человека могли так прозвать? Самая прямая версия — этническая. В Сибири и на Дальнем Востоке, особенно после присоединения Приамурья к России в середине XIX века, контакты с маньчжурами были регулярными: торговля, пограничная служба, дипломатические миссии. Русский, долго живший среди маньчжуров или женатый на маньчжурке, мог получить прозвище Манчур. Другой вариант: так могли назвать внешне похожего на азиата человека — с узкими глазами, смуглой кожей. В северных и сибирских говорах прозвища по этническому признаку давали без злого умысла, скорее как опознавательный знак.

Суффикс -ин типичен для русских фамилий, образованных от прозвищ и существительных мужского рода на -а/-я или на твёрдый согласный: Манчур — Манчурин. Форма с -ов (Манчуров) тоже встречается, но реже. Унбегаув в «Русских фамилиях» указывает, что фамилии на -ин от этнонимов — обычное дело (Татарин — Татаринов, Грек — Греков, Немец — Немцов). Манчурин стоит в том же ряду, но с более узкой географией: основная зона бытования — Забайкалье, Приморье, Амурская область, а также потомки казаков, служивших на границе с Китаем.

Встречается и менее вероятная, но лингвистически возможная версия: от диалектного слова «манчур» — так в некоторых говорах называли манок на птицу, особую дудку. Но подтверждений этому в словарях почти нет, а этническая гипотеза и проще, и логичнее.

Сословно Манчурины — почти наверняка крестьяне или казаки. Дворянских родов с такой фамилией в «Бархатной книге» или «Общем гербовнике» нет. Фамилия нечастотная, но устойчивая: носители живут в России, есть в Украине и Беларуси — следствие переселений и советских миграций.