Фамилия Мандрыгин — одна из тех, где за простой на первый взгляд основой скрывается сразу несколько возможных историй. Образована она по самой распространённой в русском языке модели: к прозвищу или имени Мандрыга добавили притяжательный суффикс -ин, означающий «чей?» — «сын Мандрыги» или «человек из семьи Мандрыги».

Сам корень фамилии — слово «мандрыга» — многозначен. В разных говорах оно обозначало разные вещи. В южных русских областях мандрыгой называли лепёшку с творогом, что-то вроде ватрушки. В Воронежской губернии так говорили о докучливом, надоедливом человеке. А в некоторых диалектах «мандрыка» — это подорожник, растение. Получается, что прозвище Мандрыга могло закрепиться за человеком по двум совершенно разным причинам: либо он был любителем сытных лепёшек (или сам их пёк), либо обладал навязчивым характером. Первая версия выглядит правдоподобнее — прозвища по еде и лакомствам в крестьянской среде встречались часто, а вот прозвище «надоедливый» редко становилось основой фамилии, которую передавали детям.

Есть и третья версия, уводящая нас в украинский язык. Украинское слово «мандрувати» означает «странствовать, идти». Если принять эту версию, то Мандрыга — это бродяга, путник, человек без постоянного дома. Такое прозвище мог получить странник, проходивший через село, или же местный житель, любивший бродить по свету. Эта гипотеза менее надёжна: фамилии от глагольных основ в русском языке образуются редко, и обычно через посредника — сначала прозвище от действия, а потом уже фамилия. Но исключать её совсем нельзя, особенно если носители фамилии встречаются в регионах, граничащих с Украиной.

Фамилия Мандрыгин — редкая. В дореволюционных справочниках и списках она почти не встречается, что говорит о её позднем закреплении или о локальном бытовании. Скорее всего, она возникла в среде крестьян или однодворцев южнорусских губерний — Курской, Воронежской, Тамбовской. Именно там фиксируются диалектные слова «мандрыга» и «мандрыка».

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то можно заметить, что суффикс -ин указывает на происхождение от слова женского или мужского рода, оканчивающегося на -а/-я. «Мандрыга» — слово как раз такого типа. Родственные фамилии — Мандрыка, Мандрыченко, Мандрыков — встречаются реже и имеют другую географию.

Точное время возникновения фамилии Мандрыгин установить сложно. Как и большинство русских фамилий, она окончательно закрепилась в XIX веке, после отмены крепостного права, когда крестьянам массово присваивали фамилии по прозвищам глав семей. До этого носитель прозвища Мандрыга мог жить и в XVII, и в XVIII веках, но фамилией это прозвище стало только в следующем столетии.