Фамилия Мангур — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычных русских суффиксов -ов, -ин или -ский, что сразу указывает: перед нами не стандартная «патронимическая» фамилия от крестильного имени, а скорее прозвище или этническое по происхождению образование. Носители фамилии встречаются в России, на Украине, в Молдове и среди гагаузов, что даёт ключ к разгадке.

Самая вероятная версия связывает фамилию с тюркскими языками. В тюркском «мангур» (или «манкурт») — это историческое и фольклорное понятие, обозначающее человека, потерявшего память и корни, превращённого в бездумного раба. Слово получило широкую известность после романа Чингиза Айтматова «Буранный полустанок» (1980). Однако в качестве фамильного прозвища оно могло закрепиться гораздо раньше, причём не обязательно с таким мрачным значением. В тюркских диалектах «мангур» могло означать «упрямый», «крепкий», «несгибаемый» — такое прозвище давали человеку с твёрдым характером.

Вторая версия — географическая. Фамилия могла возникнуть у выходцев из населённого пункта с похожим названием. В Молдове и Приднестровье есть село Мангура (в Каушанском районе), где исторически жили гагаузы и молдаване. Жителя этого села могли прозвать Мангуром — по месту жительства. Такая модель образования фамилий (без суффикса, чистая топонимическая основа) характерна для южнославянских, молдавских и гагаузских традиций.

Третья, менее распространённая гипотеза — связь с украинским или польским диалектным словом «мангур» (от венгерского «mangó» — «неуклюжий, неловкий человек»). В этом случае фамилия могла возникнуть как насмешливое прозвище.

Фамилия Мангур не имеет отношения к дворянским родам или старинным русским боярским фамилиям — она из народной, прозвищной среды. Суффиксальный нуль (отсутствие окончания -ов/-ин) говорит о том, что фамилия могла закрепиться в своей исходной, неизменённой форме, что типично для украинских, белорусских и южнорусских фамилий, а также для фамилий неславянских народов, вошедших в русскую культуру.