Фамилия Манняпов — один из тех редких случаев, когда привычный русский суффикс -ов встречается с основой, явно не славянского происхождения. На слух она звучит по-русски, но корень ведет в тюркские языки, скорее всего в татарский или башкирский.

В основе фамилии лежит личное имя Манняп (или Маннап). Это имя, в свою очередь, восходит к арабскому «маннаф» — «высокий», «возвышенный» или «тот, кто возвышает». В мусульманской ономастике такие имена давали с пожеланием ребенку высокого положения, уважения или духовного роста. Вариант с двумя «н» — Манняп — мог закрепиться в произношении под влиянием местных диалектов или просто как особенность записи в документах XIX — начала XX века.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Манняп добавили патронимический суффикс -ов, означающий «сын Манняпа» или «принадлежащий Манняпу». Такую форму получали, когда главу семьи записывали в метрики или ревизские сказки. Это типично для татарских и башкирских фамилий, которые оформились в среде служилых людей, торговцев или крестьян после введения всеобщей переписи.

Географически фамилия Манняпов тяготеет к регионам с компактным проживанием татар и башкир: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская, Челябинская области. Встречается она нечасто, что говорит о ее локальном характере — возможно, родоначальник был выходцем из конкретного села или рода.

Примечательно, что в русском языке имя Манняп не имеет однокоренных слов, поэтому фамилия стоит особняком среди более привычных Кузнецовых или Ивановых. Ее носителю не стоит искать прозвища, связанного с ремеслом или внешностью: перед нами чистый патроним, за которым стоит имя с красивым значением.