Фамилия Манулычев сразу обращает на себя внимание суффиксом. В русских фамилиях часто встречаются -ов, -ев, -ин, а здесь — -ычев. Такая форма указывает на происхождение от прозвища или имени, которое заканчивалось на -ыч. Чаще всего это отчество в притяжательной форме: Манулыч — это сын Манула. А суффикс -ев добавлен по правилу: после мягкого согласного (ч) пишется -ев, а не -ов.

Основа фамилии — мужское имя Манул. В русском именослове это календарное имя, одна из народных форм крестильного имени Мануил (от древнееврейского Иммануэль — «с нами Бог»). В быту имя Мануил часто сокращали и переделывали: Мануйла, Мануха, Мануша, а форма Манул — одна из самых кратких. Она встречалась в северных и центральных губерниях России, особенно среди крестьян и мещан. Имя было нередким вплоть до XIX века, но после революции почти вышло из употребления.

Таким образом, Манулычев буквально означает «внук Манула» или «потомок того, кого звали Манул». Фамилия образована по продуктивной модели, когда к отчеству на -ыч добавляли фамильный суффикс -ев. Модель эта распространена в основном в северорусских и поволжских говорах, где любили краткие формы имён. Аналогично возникли фамилии Иванычев (от Иваныч), Степанычев, Петрычев.

Интересная деталь: в некоторых говорах имя Манул могли путать с названием дикой кошки — манула. Но это случайное совпадение. Зверь манул стал известен в науке только в XVIII веке, а фамилии на -ычев — явление более древнее. Так что происхождение здесь чисто антропонимическое, от личного имени, а не от прозвища по животному.

Встречаемость фамилии невысокая. По данным открытых источников, Манулычевы живут в основном в центральной России и в Поволжье. В дворянских родословных книгах фамилия не значится: это фамилия крестьянская или мещанская, что подтверждает её происхождение от просторечной формы канонического имени.