Фамилия Манжилеев — редкий случай, когда географическая привязка оказывается надёжнее, чем прозрачная этимология. Сразу можно сказать: её корни ведут в Калмыкию и, шире, в монгольский мир. Основа фамилии — личное имя Манжил (или Манжл), которое в тюрко-монгольской среде могло иметь два источника.

Первый и наиболее вероятный — буддийский. В калмыцкой ономастике распространены имена, связанные с религиозными терминами. «Манжил» — это искажённое «Манджушри» (санскр. मञ्जुश्री), имя бодхисаттвы мудрости. В тибетской и монгольской традиции это имя давали мальчикам, чтобы передать им качества учёности и проницательности. Со временем имя сократилось до Манжи, Манжл или Манжил, а фамильный суффикс -еев (калмыцкий вариант русского -ев) закрепил родовую принадлежность: «сын Манжила», «из рода Манжила».

Вторая версия — бытовая. В некоторых тюркских языках, в частности в карачаево-балкарском, существует слово «манжыл» или «манжил» со значением «непоседа», «ершистый», «человек, который не сидит на месте». Если фамилия возникла в среде, удалённой от буддийских центров, прозвище Манжил могли дать за характер. Однако для фамилии Манжилеев, с её характерным калмыцким суффиксом, религиозная версия выглядит убедительнее.

С точки зрения словообразования, фамилия построена по типичной для калмыцких фамилий модели: основа (личное имя) + суффикс -ев/-еев. В русской записи через «е» после мягкого «л» (Манжил-еев) отразилось произношение, где гласный в суффиксе смягчается. В самой Калмыкии фамилию могли записывать и как Манжилов, но вариант на -еев чаще встречается в документах XX века.

Сословная принадлежность предков не фиксируется — фамилия не дворянская и не купеческая. Носители Манжилеевы, скорее всего, были простыми скотоводами или крестьянами, а само имя Манжил давалось без привязки к социальному статусу. Встречаемость фамилии крайне низкая за пределами Калмыкии и нескольких районов Астраханской области, куда калмыки переселялись в XVIII–XIX веках.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Манжиков, Манжинов) показывает, что все они отталкиваются от одного корня, но суффиксы различают ветви одного рода или разные диалектные записи. Манжилеев — одна из таких ветвей, сохранившая в фамилии буддийское имя, которое для постороннего уха звучит загадочно, а для носителя — как прямая отсылка к предку-мудрецу.