Фамилия Маратаева образована от имени Маратай (буквально - маленький Марат). По одной из версий, оно восходит к мусульманскому имени Мурат, которое в переводе с арабского означает «цель, намерение, желание; желанный». Возможно, что Марат — это один из диалектных вариантов имени Марат. Однако существует и другое предположение, согласно которому Марат — это новое имя в честь одного из лидеров Французской буржуазной революции Жана-Поля Марата (1747 - 1793), получившее широкое распространение у татар в 30-е годы ХХ века. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Маратаевых можно лишь на основании генеалогических исследований.