Фамилия Мардин образовалась от прозвища Марда. В олонецких говорах Русского Севера словом «марда» называли вершу — рыболовную снасть, сплетённую из ивовых прутьев в виде узкой круглой корзины с воронкообразным отверстием. Прозвище относилось к числу профессиональных именований: предок носителя фамилии, скорее всего, занимался рыбной ловлей.

Слово «марда» употреблялось довольно редко и только в северных диалектах. Это позволяет с большой вероятностью утверждать, что основатель рода Мардиных был уроженцем Русского Севера. Фамилия образована по типичной русской модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Мардин, то есть сын или потомок Марды. Таким образом, фамилия Мардин означает «потомок человека по прозвищу Марда» и хранит память о занятии далёкого предка-рыбака.