Фамилия Маргаридин звучит так, будто её носитель — потомок человека с редким и красивым именем Маргарид. Так оно и есть. Это одна из тех фамилий, которые образовались не от крестильного, а от мирского, нецерковного имени или прозвища. Основа здесь — греческое слово «маргаритес», то есть жемчуг. В русском языке оно дало имя Маргарита, а также более редкое мужское имя Маргарид, которое встречалось в среде духовенства и образованных горожан. В старину так могли назвать мальчика, желая ему чистоты и драгоценности, или же дать прозвище человеку с белыми зубами, светлой кожей или любящему наряды.

Модель образования фамилии проста и показательна. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Маргаридин — это «сын Маргариды» или «человек из семьи Маргариды». Такие фамилии в русском языке чаще всего возникали от имён и прозвищ, оканчивающихся на -а или -я. Если бы основа была на согласный, мы бы получили Маргаридов, но форма с -ин закрепилась, что говорит о древности и устоявшемся произношении.

Географически фамилия Маргаридин — редкая. В дореволюционных справочниках она почти не встречается среди крестьян и купцов центральной России. Гораздо чаще её можно найти на юге, особенно в казачьих областях (Дон, Кубань) и в среде духовенства. Священники и дьячки нередко давали детям «цветочные» и «драгоценные» имена (Розов, Фиалков, Аметистов), и Маргаридин вполне могла возникнуть в семинарской среде как искусственная, «благозвучная» фамилия. Вторая версия — прозвищная, от слова «маргарид» в значении «жемчужина»: так могли прозвать мастера-ювелира, торговца жемчугом или просто аккуратного, щеголеватого человека.

С точки зрения словообразования, фамилия стоит в одном ряду с такими, как Рубинов, Алмазов, Изумрудов. Но если те фамилии часто давали в духовных училищах по цветам литургических облачений, то Маргаридин ближе к личному имени. Это придаёт ей особый оттенок: её носитель, скорее всего, потомок человека, которого в миру или в церковном обиходе называли Маргаридом, а не просто «жемчужным». Встречаются и варианты написания — Маргаридын, но они ещё реже и обычно являются результатом диалектного произношения или ошибок писаря.

Таким образом, фамилия Маргаридин — это памятник редкому имени и, возможно, свидетельство о принадлежности предка к духовному сословию или к южнорусским казакам. Она не массовая, но точно несёт в себе оттенок старины и книжной культуры.