Фамилия Марголин — один из ярких примеров того, как еврейское имя адаптировалось к русской словообразовательной модели. В основе лежит женское имя Маргалит (в ашкеназском произношении — Маргулис), которое с иврита переводится как «жемчуг» или «жемчужина». Но фамилию образовали не напрямую от полной формы, а от её русской уменьшительной — Марголя. Именно этот шаг — переход от книжного, библейского имени к бытовому, ласкательному прозвищу — и дал фамилию, которая звучит по-русски.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Марголин, то есть сын или потомок Марголи (Маргалит). Такая модель типична для восточнославянских фамилий, но в еврейской среде на территории Российской империи она прижилась особенно прочно. В документах XIX века фамилия Марголин фиксируется в черте оседлости — на территории современных Украины, Беларуси и Литвы. Встречаются варианты написания: Марголин, Маргулин, а также однокоренные Марголис и Маргулис, где сохранён исходный корень без уменьшительного суффикса.

Словообразовательная цепочка здесь необычна: от ивритского «маргалит» (жемчуг) к русскому «Марголя» (ласкательное имя) и затем к фамилии с патронимическим суффиксом. Жемчуг в еврейской традиции — символ драгоценности и мудрости, поэтому имя Маргалит было популярным, а фамилия Марголин встречается нередко. В отличие от фамилий, образованных от профессий или географических названий, эта целиком восходит к личному имени — и именно женскому, что для XIX века было менее характерно, но в еврейской ономастике встречается.

Таким образом, предки носителя фамилии Марголин — скорее всего, еврейские семьи из черты оседлости, где имя Маргалит передавалось через поколения, а при переходе на фамилии в начале XIX века закрепилось в форме Марголин.