Фамилия Марцын — один из тех случаев, когда неочевидное написание скрывает простую и прозрачную этимологию. Если отбросить русский суффикс принадлежности -ин, остаётся основа Марц-. Это адаптированная форма имени Марк, а точнее — его уменьшительно-ласкательного варианта. В южно- и западнославянских языках, а также в украинском и белорусском, имя Марк часто преобразовывалось в Марцо, Марць, Марцко. От такого прозвища или обиходной формы и возникла фамилия: Марця (Марцо) + -ин = «сын Марцы», «потомок человека по имени Марцо».

Особенность фамилии — в её географическом ареале. Суффикс -ин в русских фамилиях типичен для севера и центра России, но основа Марц- с «ц» вместо «к» выдаёт западное влияние. Скорее всего, фамилия сформировалась на землях современной Беларуси или Западной Украины, откуда вместе с носителями могла мигрировать в центральные регионы. В польском языке, например, фамилия Marciniak (от Marcin — Мартин) встречается часто, но Марцын — это прямой гипокористик от Марк, что реже.

Второй, менее вероятный вариант — связь с польским словом marcyć (мечтать, грезить) или mara (призрак, мара). Но в таком случае фамилия звучала бы как Марцин или Марчиньский, а форма Марцын слишком конкретна и указывает на личное имя. Поэтому версия с именем Марк остаётся основной.

По сословной принадлежности фамилия не даёт точных указаний: -ин могли носить и крестьяне, и мещане, и духовенство. Но если предки происходили с запада Российской империи, где фамилии на -ин у простого населения закреплялись позже (в XVIII–XIX веках), то Марцын могла возникнуть как уличное прозвище, записанное в метрику уже при унификации фамилий.

Написание с «ы» вместо «и» — тоже маркер. В русском языке после «ц» под ударением пишется «ы» (Марцын), а в украинском и белорусском — «і» (Марцін). Если ваши предки писались через «і», это указывает на украинское или белорусское происхождение; если через «ы» — на адаптацию в русской среде.