Фамилия Марукины, как и многие русские фамилии, прошла долгий путь становления, но её основа довольно прозрачна. В её ядре лежит имя или прозвище Мара. В древней славянской традиции Мара — это не просто имя, а слово, означающее «призрак», «видение», «наваждение». Такое мирское имя могли дать ребёнку в качестве оберега: считалось, что злые силы не позарятся на того, кто уже назван «призраком». Однако это лишь одна из версий.

Более вероятно, что Мара — это сокращённая, уменьшительная форма от целого ряда крестильных имён, начинающихся на «Мар-»: Марк, Марий, Мартин, Мавродий. В бытовой речи такие имена неизбежно укорачивались до простого и удобного «Мара» или «Маря». Таким образом, Марукины — это потомки человека по имени Мара, причём неважно, было ли это его полное мирское имя или домашнее прозвище.

Ключевой элемент фамилии — суффикс «-ук». В отличие от стандартной русской модели «-ов/-ев» или «-ин», суффикс «-ук» (а также «-юк») — яркий маркер белорусского и западноукраинского происхождения. Он означает «маленький» или «сын»: Марук — это «маленький Мара» или «сын Мары». Фамилия Марукин, в свою очередь, образовалась от этого западнорусского прозвища Марук с помощью уже великорусского притяжательного суффикса «-ин», который отвечает на вопрос «чей?». Получается цепочка: Мара → Марук (сын Мары) → Марукин (сын Марука). Такое смешение суффиксов говорит о том, что предки Марукиных, вероятно, были выходцами из белорусских земель, которые затем переселились в центральную или северную Россию, где их фамилию «обрусили», добавив привычное окончание.

Определить точное сословие или место появления фамилии сложно: процесс шёл несколько столетий. Однако сам факт, что фамилия не была образована от церковного календарного имени напрямую, а прошла стадию прозвища, намекает на её возможное крестьянское или посадское происхождение — в среде духовенства такие «некалендарные» имена встречались реже. Фамилия Марукины — редкий пример того, как в одном слове соединились древняя славянская языческая традиция имён-оберегов, западнорусская модель образования фамилий и более поздняя великорусская адаптация.