Фамилия Марихин — один из примеров метронимических фамилий, то есть образованных от женского имени. В основе лежит имя Мариха, которое чаще всего считают производной формой крестильного имени Марина (от латинского «marinus» — морской). Реже Мариху связывают с именем Мария, что в переводе с древнееврейского означает «госпожа» или «желанная». Обе версии относятся к церковной традиции именования, поэтому основная версия происхождения фамилии — именно от женского личного имени.

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — сын Марихи). Такая форма характерна для территорий, где были распространены «уличные» варианты имён на -иха. Интересно, что имя Мариха встречается в северных и центральных областях России, что может указывать на географию возникновения фамилии.

Существует и альтернативное объяснение: от прозвища Мариха, связанного с глаголом «марать» — так могли назвать неопрятного или пачкотливого человека. Однако эта версия менее убедительна: во-первых, прозвища на -иха чаще давали женщинам, во-вторых, связь с устойчивым именем Марина или Мария выглядит логичнее с точки зрения частотности. Прозвищное происхождение не исключено, но уступает метронимическому по вероятности.

Фамилия Марихин фиксируется в документах с XVIII века, преимущественно в купеческой и крестьянской среде. Встречается также вариант Марихина — женская форма, которая не меняет сути этимологии. В современных справочниках фамилию относят к числу редких, что делает её особенно интересной для генеалогического поиска.