Фамилия Маржанов — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, не имеет однозначного русского корня, а восходит к тюркскому или арабскому миру. В отличие от большинства фамилий на -ов, образованных от крестильных имён или профессий, Маржанов напрямую связан со словом «маржан» — так в тюркских языках (татарском, казахском, башкирском) называют коралл, жемчуг или бусы из них. Слово пришло из персидского и арабского, где «марджан» означает именно коралл.

Суффикс -ов указывает на русскую модель оформления фамилии: к основе «Маржан» добавили типичный для великорусских земель патронимический суффикс. В этнически смешанных регионах — Поволжье, Приуралье, отчасти в казахских степях — так нередко русифицировали тюркские прозвища. Поэтому предок носителя фамилии мог быть татарином, башкиром или казахом, которого в документах записали по-русски: «Маржанов сын», то есть сын человека по прозвищу Маржан.

Прозвище Маржан могло иметь несколько значений. Первое — прямое: человека так называли за любовь к украшениям, за яркую внешность или за то, что он торговал бусами и кораллами. Второе — переносное: в тюркской традиции «маржан» могло быть ласковым обращением к ребёнку, как «жемчужинка». Третья версия — это могло быть женским именем Маржан (встречается у казахов и татар), и тогда фамилия Маржанов — это «сын Маржан», то есть образована от имени матери. Такие матрилинейные фамилии редки, но в тюркской среде возможны.

Географически фамилия встречается в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Челябинской областях, а также у казахов. В дореволюционных метрических книгах Маржановы не принадлежали к дворянству — это фамилия крестьянского, мещанского или торгового сословия. Интересно, что в русском языке есть однокоренная, но более поздняя фамилия Маржановский — она уже явно указывает на польское или украинское происхождение с суффиксом -ский, но её основа та же: «маржан» как прозвище или название местности.

Споров вокруг этимологии почти нет: тюркский корень очевиден. Альтернативная версия — от русского слова «маржа» (торговая наценка) — неубедительна, так как слово «маржа» вошло в обиход поздно и не дало прозвищ. Так что Маржанов — это фамилия, которая чётко маркирует тюркские корни её носителя, а за прозвищем стоит либо торговец, либо человек, кого в семье называли «кораллом».