Фамилия Машонина, предположительно, образована от имени Машоня, которое является производной формой имени Мария. По одной из версий оно переводится с древнееврейского как «отвергнутая, горькая», а по другой – «печальная, мятежная». Имя Мария одно из самых распространенных, поскольку оно принадлежало матери Иисуса Христа. В результате, потомок женщины, обладающей именем Машоня, со временем получил фамилию Машонина. Представители фамилии Машониных внесены в некоторые Памятные книги. Так, например, в Книге памяти Московской области упоминается Иван Алексеевич Машонин, родившийся в 1885 году в Серпухове Московской области. В Книге памяти Омской области содержится информация о Николае Трофимовиче Машонине, родившемся в 1913 году в селе Нахимовка Называевской волости Тюкалинского уезда Омской губернии. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Машоня можно лишь на основании генеалогических исследований.