Фамилия Масютина образована от личного имени или прозвища Масюта. Чаще всего его считают уменьшительной формой крестильного имени Максим, которое восходит к латинскому maximus — «самый большой». Такой путь типичен для русской ономастики: народные формы вроде Максюта, Масюта, Макша, Максимка заменяли полное имя в быту, а уже от них возникали фамилии.

Есть и вторая версия, более редкая. Она связывает Масюту с украинским прилагательным «масюнiнький» — «маленький, крошечный». В дохристианской традиции ребёнку могли дать имя-оберег со значением «малый», чтобы уберечь его от сглаза и болезней. Обычай держался стойко: даже после крещения Руси детей нередко называли Малой, Малец, Масюта наряду с церковными именами. Из этого пласта имён выросли целые семейства фамилий, и Масютины стоят в одном ряду с Малецкими, Малыми, Масловыми.

Какая версия правдоподобнее? Первая — от Максима — выглядит убедительнее. Она опирается на живую словообразовательную модель: суффикс -ют-/-ут- активно работал в народных формах крестильных имён (от Гавриил — Гаврюта, от Михей — Михута). Украинское «масюнiнький» — слово позднее и диалектное, вряд ли оно породило устойчивое имя в северных и центральных русских землях, где фамилия Масютиных встречается чаще.

Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: Масютина — «дочь или жена Масюты», а в традиционной русской модели — вообще потомок человека по имени Масюта. Форма с -ин характерна для имён, оканчивающихся на -а, и здесь она закономерна.

О социальном происхождении рода говорит раннее документальное свидетельство. В труде историка С. Веселовского упомянут Масютин Павел, посадский человек из Дорогобужа, запись относится к 1660 году. Посадские люди — это торгово-ремесленное население городов, не дворяне и не крепостные. Значит, уже в XVII веке фамилия бытовала в среде свободных горожан, и основатель рода, скорее всего, тоже был человеком простого звания.

В написании фамилии встречается вариант Масютин — без конечной -а, он указывает на мужского предка. Форма Масютина — это женский вариант или указание на принадлежность к роду через женскую линию, но в быту так же называют и мужчин, если речь идёт о фамилии в именительном падеже женского рода. Путаница возникает из-за того, что в современных документах у женщин фамилия не склоняется по родам, а у мужчин пишется Масютин.